El Proyecto Educativo Institucional PEI, reformulado en el  año 2007,  definió nueve principios para la política de investigación así:

Principio 1. La investigación en UNILATINA se puede realizar tomando como marco conceptual la Teoría Analítica, o positivismo, o empirismo lógico.

Principio 2. La investigación en UNILATINA se puede realizar tomando como marco conceptual la Teoría Crítica de la Ciencia o Dialéctica.

Principio 3. La investigación en UNILATINA puede tomar como objeto algunas disciplinas y prácticas que se escapan de los paradigmas compartidos por las comunidades científicas normales. Allí podemos realizar investigación de punta.

Principio 4. En la investigación científica normal debemos tener como meta que ésta sea de utilidad para alguien.

Principio 5. Las investigaciones histórica y hermenéutica se aceptan como científicas.

Principio 6. El hombre es un ser en relación que efectúa la investigación científica de acuerdo con sus intereses, pero con implicaciones morales, éticas y políticas.

Principio 7. La inferencia estadística es de gran utilidad para buscar el respaldo de los hechos.

Principio 8. La lógica es útil para demostrar proposiciones complejas respaldadas por la realidad empírica.

Principio 9. Los enunciados de las ciencias no son estáticos. Cambian de acuerdo con el paradigma.